NICHT MEHR IM SS2016! M4208 Bakterien im Biofilm
Organisation
Dr. Jörg Overhage, Dr. Andreas Dötsch
maximal 6 Teilnehmer!
Kursort: KIT Campus Nord, Institut für Funktionelle Grenzflächen (IFG) Gebäude 330, Raum 266
Zeit: SS; 2. Block
Anrechenbarkeit/Fächer
Masterfächer: Mikrobiologie, Technische Biologie, Molekularbiologie
Lernnachweis
Klausur zu Vorlesungs- und Praktikumsinhalten.
Teile
a) Theoretischer Teil "Bakterien im Biofilm "
b) Praktischer Teil "Bakterien im Biofilm"
Kursinhalt:
Biofilme sind mikrobielle Lebensgemeinschaften an Grenzflächen und stellen die bedeutendste Lebensweise von Bakterien dar. In einem Biofilm sind die Mikroorganismen in eine extrazelluläre, polymere Matrix (EPS) bestehend aus Proteinen, Nukleinsäuren und Exopolysacchariden eingebettet und somit vor äußeren Einflüssen geschützt. In den letzten Jahren hat man erkannt, dass Bakterien in Biofilmen völlig andere Eigenschaften als freilebende, planktonische Zellen aufweisen können und dass Biofilme sowohl in der Umwelt als auch in Medizin und Technik eine sehr wichtige Rolle spielen. Natürlich wachsende Biofilme bestehen dabei in der Regel aus einem Gemisch verschiedener Spezies von Bakterien und anderen Mikroorganismen, wovon ein großer Teil mit den üblichen Methoden nicht kultivierbar sind. Zur umfassenden Untersuchung der Gemeinschaft wendet man daher DNA- und RNA-basierte Techniken an, bis zur vollständigen Genomsequenzierung. In diesem Praktikum sollen die StudentInnen einen Einblick in Struktur, Vorkommen und Eigenschaften von bakteriellen Biofilmen gewinnen und die nötigen mikroskopischen, molekularbiologischen und kulturunabhängigen Methoden kennenlernen.
Kursprogramm:
- Kultivierung von Bakterien in unterschiedlichen Biofilmreaktoren
- Analyse von Biofilmen mit Hilfe mikroskopischer und molekularbiologischer Methoden
- Nachweis und Relevanz von Signalmolekülen (Signal-Transduktion)
- Behandlung von Biofilmen mittels Antibiotika
- Opportunistisch humanpathogene Mikroorganismen (L2/S2) als Modellsysteme
- Kulturunabhängige Charakterisierung von unbekannten Bakteriengemeinschaften
- Einführung in die Auswertung großer Mengen von Sequenzdaten (Genom und Transkriptom)
